MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci RD1 plasmid pRD1

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014797	GGT	2	6	12	17	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014797	GGT	2	6	34	39	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014797	GGT	2	6	56	61	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014797	GGT	2	6	78	83	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014797	A	7	7	97	103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014797	TA	3	6	1086	1091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014797	GAT	2	6	1098	1103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014797	T	6	6	1121	1126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014797	ATT	2	6	1135	1140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014797	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014797	TTG	2	6	4682	4687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014797	A	8	8	4694	4701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014797	TTAAA	2	10	4702	4711	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014797	TTAA	2	8	5547	5554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014797	AT	3	6	5555	5560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014797	T	8	8	5573	5580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014797	A	6	6	5594	5599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014797	GA	3	6	5618	5623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014797	CAG	2	6	7489	7494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014797	GAA	2	6	7548	7553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.